การดำเนินงาน ดูแล บริหาร วัดไทยพุทธคยา ได้นำหลักการที่สืบทอดต่อทางของพระธรรมทูตมาสายอินเดียมาตั้งแต่ยุคสมัยของ
เจ้าประคุณสมเด็จพระธีรญาณมุนี (ธีร์ ปุณฺณกมหาเถร ป.ธ.๙) ท่านเจ้าคุณหลวงพ่อพระสุเมธาธิบดี (ทตฺตสุธิมหาเถร ป.ธ.๘) และท่านเจ้าคุณอาจารย์พระเทพโพธิวิเทศ (ทองยอด ภูริปาโล ป.ธ.๙)
รวมเส้นทางการบริหารจัดการ
จากแนวความคิดที่เขียนไว้ในกระดานหน้าห้อง จึงนำมาเป็นแนวทางบริหารวัดไทยพุทธคยา
เป็นเบื้องต้น ดังนี้
๑. จัดระบบงาน
๒. จัดบุคคลเข้าระบบ
๓. พัฒนาบุคคลให้มีความสามารถเหมาะสมกับหน้าที่
๔. ให้สวัสดิการสมควรแก่
ความรับผิดชอบ